Wissenschaftler / Doktoranden
PhD-Student*in (m/w/d) für die Gruppe „Experimentelle Ultrahochfeld-MR“
Biomedizin, Medizinphysik, Bildgebung, Data Science oder artverwandte Fächer
Team
Niendorf Lab
Das Max-Delbrück-Centrum für Molekulare Medizin in der
Helmholtz-Gemeinschaft gehört zu den international
führenden biomedizinischen Forschungszentren.
Nobelpreisträger Max Delbrück, geboren in Berlin, war
ein Begründer der Molekularbiologie. An den
MDC-Standorten in Berlin-Buch und Mitte analysieren Forscher*innen
aus rund 60 Ländern das System Mensch – die Grundlagen des
Lebens von seinen kleinsten Bausteinen bis zu
organübergreifenden Mechanismen. Wenn man versteht, was das
dynamische Gleichgewicht in der Zelle, einem Organ oder im ganzen
Körper steuert oder stört, kann man Krankheiten
vorbeugen, sie früh diagnostizieren und mit passgenauen
Therapien stoppen. Die Erkenntnisse der Grundlagenforschung sollen
rasch Patient*innen zugutekommen. Das MDC fördert daher
Ausgründungen und kooperiert in Netzwerken. Besonders eng
sind die Partnerschaften mit der Charité –
Universitätsmedizin Berlin im gemeinsamen Experimental and
Clinical Research Center (ECRC) und dem Berlin Institute of Health
(BIH) der Charité sowie dem Deutschen Zentrum für
Herz-Kreislauf-Forschung (DZHK). Am MDC arbeiten 1.600 Menschen.
Finanziert wird das 1992 gegründete MDC zu 90 Prozent vom
Bund und zu 10 Prozent vom Land Berlin.
Die Gruppe „Experimentelle Ultrahochfeld-MR“ unter der Leitung von
Professor Thoralf Niendorf sucht eine/n Doktorandin/en auf dem
Gebiet der Biomedizin, Medizinphysik, Bildgebung, Data Science
oder artverwandter Fächer und mit Erfahrung in der
Magnetresonanztomographie (MRT), vorzugsweise auf dem Gebiet der
kardialen MRT (CMR). Der/die Kandidat/in wird an dem Projekt
„cardiacMRBIOPSY – Non-invasive Monitoring of Hypertrophic
Cardiomyopathy using Cardiac Magnetic Resonance Virtual Biopsy“
beteiligt sein und sich mit CMR-basierten „virtuellen Biopsien“
beschäftigen, um die Kinetik der mikrostrukturellen
Veränderungen des Herzmuskels zu verfolgen und das
Fortschreiten der Krankheit bei hypertropher Kardiomyopathie
vorherzusagen. Das Projekt wird von der Deutschen
Forschungsgemeinschaft (DFG ) gefördert und der/die
Kandidat/in wird mit Wissenschaftlern des Hasso-Plattner-Instituts (HPI) und anderen beteiligten Partnern zusammenarbeiten,
darunter auch Wissenschaftler des Fraunhofer Heinrich-Hertz-Instituts (HHI).
Ihre Aufgaben
-
Optimierung neuartiger Methoden zur Erfassung von Herz-MRT-Daten
für die Quantifizierung von Veränderungen im Herzen
von Kleintieren
- Anwendung neuartiger kardialer MRT-Methoden
-
Etablierung eines kardialen MRT-Phänotypisierungsverfahrens
zur Überwachung der Krankheitskinetik bei Kleintieren
-
Längsschnittliche Bewertung und Analyse der Kinetik einer
Herzerkrankung mittels MRT
-
Anwendung von mikroskopischen und biochemischen Methoden zur
Korrelation mit den bildgebenden Befunden
-
Quantitative Untersuchung und Korrelation von
MRT-Bildgebungsmarkern und histologischen Parametern, um
Abhängigkeiten über den gesamten Verlauf der
Herzerkrankung zu erkennen
-
Analyse von Bildgebungsdaten: Anwendung von räumlicher
Ausrichtung und Registrierung zur Korrektur von
Bewegungsartefakten bei MRT-Daten und anschließende
Konturierung der gewünschten Regionen von Interesse mit
Hilfe von Computerprogrammen
-
Bestimmung, ob es eine statistisch signifikante zeitliche
Beziehung zwischen bildgebenden Ereignissen in Zeitreihen gibt;
Entwicklung von Algorithmen für maschinelles Lernen zur
Vorhersage des Krankheitsverlaufs anhand von Bildgebungsmarkern
und histologischen Indizes
-
Erforschung der Auswirkungen von Pharmakotherapien auf den
myokardialen Remodeling-Prozess
-
Zusammenarbeit mit internen und externen Gruppen und Darstellung
der eigenen Tätigkeit in Form von Vorträgen, Berichten
und Veröffentlichungen (Abhandlungen und Dissertation).
-
Aktive Teilnahme an der MRT- sowie der kardiovaskulären
Gesellschaft
Ihr Profil
-
Teamfähigkeit, proaktives Lernen, Fähigkeit zu
interdisziplinärem Denken, hohes Maß an
Eigeninitiative und Engagement
-
Hochschulabschluss (Diplom/Master) im Bereich Biologie,
molekulare Medizin, Biomedizin, medizinische Physik, Bildgebung,
Data Science oder artverwandter Fächer
-
Allgemeines technisches Verständnis und experimentelle
Fähigkeiten
-
Ausreichende Kenntnisse der englischen Sprache in Wort und
Schrift
- Grundkenntnisse in kardiovaskulären Themen
- Grundkenntnisse in der Datenverarbeitung
- Grundkenntnisse der Biotechnologien
-
Praktische Erfahrung in der Durchführung und Auswertung von
MRT-Messungen ist von Vorteil
-
Von Vorteil sind Kenntnisse in einer oder mehreren für die
Aufgabenstellung relevanten Programmiersprachen (z. B.
Python, Matlab)
Ihre Benefits
-
Internationales Arbeitsumfeld mit Kommunikation in englischer
und deutscher Sprache
-
Interessante Karrieremöglichkeiten und umfangreiches
Qualifizierungs- und Weiterbildungsangebot
-
Vereinbarkeit von Familie und Beruf zertifiziert durch das Audit
berufundfamilie
-
Vielfältige Unterstützung für
„Neu-Berliner*innen“ (Welcome & Family Office)
- Betriebliches Gesundheitsmanagement mit Fitness-Center
Außerdem profitieren Sie von:
-
Einer Vergütung nach dem Tarifvertrag für den
öffentlichen Dienst des Bundes (TVöD-Bund), inklusive
zusätzlicher betrieblicher Altersversorgung
-
Flexiblen Arbeitszeiten und Unterstützungsangeboten
für die Kinderbetreuung
-
Einem idyllischen grünen Campus, der bestens mit Fahrrad,
ÖPNV oder dem Auto zu erreichen ist
Vergütung
Die Vergütung erfolgt nach TVöD Bund, je nach Vorliegen
der persönlichen Voraussetzungen bis Entgeltgruppe 13.
Beschäftigungsumfang
PhD
Die Anzahl der Wochenstunden beträgt 25,35 Stunden.
Gewünschter Eintrittstermin
1. April 2022
Befristung
Die Stelle ist zunächst für 3 Jahre befristet.
Bewerbungsfrist
31. Januar 2022
Das MDC engagiert sich für Vielfalt und setzt sich aktiv
für die Chancengleichheit aller Beschäftigten
unabhängig von Herkunft, Religion, Weltanschauung,
gesundheitlicher Beeinträchtigung, Alter oder sexueller
Identität ein. Wir freuen uns auf Bewerbungen von
aufgeschlossenen Menschen, die gerne in diversen Teams arbeiten.
Bewerbungen von Schwerbehinderten werden besonders
berücksichtigt.
Kontakt
Min-Chi Ku
AG Niendorf
min-chi.ku@mdc-berlin.de
Bitte reichen Sie Ihre aussagekräftige Bewerbung über
unser
Online-Portal
mit Motivationsschreiben, Lebenslauf (ohne Foto, ohne Altersangabe
und ohne Informationen über Ihren Familienstand) und weiteren
relevanten Anlagen ein.