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Fraunhofer-Institut für Silicatforschung
Lebende Zellen sind einer Vielzahl externer Stimuli ausgesetzt, von chemischen Gradienten über elektrische Felder bis hin zu den mechanischen Eigenschaften ihres Substrats. Diese Einflüsse spiegeln sich unter anderem in der Morphologie, Adhäsion oder Proliferation der Zellen wider. Speziell die Zellmorphologie kann ein wichtiger Read-Out der Zellreaktion auf ein neuartiges Material oder eine (Nano-)Strukturierung sein. Ein Beispiel wäre, Teile von Implantaten mit Zellen zu besiedeln und diese dann in direktem Kontakt und unter dem Einfluss eines Medikaments mikroskopisch zu untersuchen.

Die Arbeit umfasst die Programmierung einer Plattform zur Verarbeitung von (Fluoreszenz-)Mikroskopie Bilddaten und Auswertung der Zellmorphologie unter dem Einfluss externer Stimuli. Als Plattform soll eine frei zur Verfügung stehende Programmiersprache gewählt werden (z.B. C++, C#, Python, …). Hierbei kommen unterschiedliche Felder der Programmierung zum Zuge:
  • Bild(sequenz)verarbeitung
  • Techniken der Segmentierung und Skelettierung
  • Bestimmung der Zellmorphologie
  • Analyse durch Bestimmung geeigneter Parameter
  • Optimierung der Prozessabläufe für große Datenmengen

Der erarbeitete Algorithmus wird dann zur Auswertung und Interpretation von Zellmessdaten der aktuellen Forschung herangezogen.

Masterarbeit zum Thema "Auswertung der Zellmorphologie unter externen Stimuli"

Kennziffer: ISC-2017-14
Ihre Aufgaben:
Ein interdisziplinäres Arbeitsfeld im industriellen Kontext der Attract 3DNanoCell Gruppe des Fraunhofer ISC, angenehme Arbeitsatmosphäre und eine hervorragende Betreuung.


Ihre Voraussetzungen:
Wir suchen Studierende der Physik oder (Bio-)Informatik o.ä. mit Spaß am Erlernen neuer Methoden und guten Programmierkenntnissen. Sie sollten teamfähig und zuverlässig sein, selbstständiges und strukturiertes Arbeiten beherrschen und Freude am konzeptionellen Arbeiten haben.


Kontakt:
Bitte richten Sie Ihre Bewerbung mit allen wichtigen Unterlagen unter Angabe der Kennziffer an:
Fraunhofer-Institut für Silicatforschung
Frau Rebohle-Mandel
Neunerplatz 2
97082 Würzburg

Fragen zu dieser Position beantwortet gerne:
Prof. Dr. Doris Heinrich
Leitung der Attract Group
Fraunhofer-Institut für Silicatforschung ISC
Neunerplatz 2
97082 Würzburg, Germany
Tel: +49 (0)931 31-81862
Web: www.isc.fraunhofer.de/3DNanoCell
Email: doris.heinrich@isc.fraunhofer.de
Fraunhofer-Institut für Silicatforschung
Würzburg

http://www.isc.fraunhofer.de


Erschienen auf academics.de am 14.03.2017
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